1994年2月，湖北省体委与武汉市体委协商，将刚刚冲上甲B的武汉队与每况愈下的湖北队合并建立湖北武钢一队和二队，在武钢集团的支持下，成立武钢职业足球俱乐部，欲集全省足球精英力冲甲A。

1996年12月29日，俱乐部更名为湖北武汉雅琪职业足球俱乐部，武汉雅琪成为中国第一家民营企业的足球俱乐部。雅琪队经过奋力拼搏，以22战12胜6平4负积42分的成绩一跃成为全国甲B联赛第一名冲A成功。

1998年，武汉队在走过了一段崎岖，武汉雅琪队在前3轮以2胜1平排在联赛积分榜榜首，被视为黑马。经过坎坷之路最终还是实现了“保九争八”的预定目标。

在1998年甲A联赛开始前几天，武烟集团出资380万元，买断雅琪1998赛季冠名权，球队更名为武汉红金龙队。1999年赛季，红桃k降回甲B。

2000年12月7日又更名为湖北武汉红桃K职业足球俱乐部。2000赛季，殷立华再执红桃K队教鞭，虽带队取得了足协杯季军、足协杯黑马奖和在联赛中取得了甲B第六。

2001赛季，“红金龙”再次赞助湖北足球。“红金龙”以700万元的价格，买下当年武汉红桃K俱乐部的球队冠名权。2001年武汉队在甲B仅列第九。

2002年，红金龙退出了对红桃K俱乐部的冠名，在有关方面的积极斡旋下，当年3月，“东湖高科”浮出水面。

2003赛季，武汉队冠名商又增加了蓝星电脑，武汉足球队更名为武汉国测蓝星队。但是在2002年和2003年，甲A取消了升降级，武汉队在甲B中又苦苦等待了2年。2003赛季结束后，红桃K集团退出足球圈。

2004年初，武汉足球俱乐部重新进行股份制改造。武汉东湖新技术开发区管委会投资设立武汉光谷建设投资有限公司。裴恩才率队杀回中超。

2005年，作为中超新军的武汉队在各路诸侯质疑的情况下，凭借在中超赛场上的“七连胜”，让人大跌眼镜，被球迷誉为本年度中国足球的最大黑马。在中超杯赛上更是一黑到底，决赛中又轻松战胜深圳健力宝捧杯。

中超球衣图鉴（16）：湖北足球26年兴衰 卓尔为汉军代言

2006赛季，武汉队因为内部原因导致大量球员流失（如老队长李昊、张斌、守门员姜涛、铁腰马成的转会出走），导致实力下降，仅仅获得第十名的成绩，勉强保级。

2007年经过裴恩才和球员努力，武汉队获得第7名的好成绩，但是球会部分领导对该成绩的却不满足，最后导致主帅裴恩才请辞及大量优秀球员出走（如年轻球员王小诗），导致俱乐部实力继续下降。

2008年，在陈方平带领下的武汉队成绩出现明显下滑，俱乐部聘请前中国男子足球队主教练朱广沪执教武汉队，其后中国国家队队长李玮峰转会武汉，此时的武汉队誓在保级。

9月25日，汉军在客场1：1艰难地战平北京国安队。这场比赛恰恰是武汉队中超历史上的第一百场比赛。但是本场赛后由于中国足协加罚了李玮峰，武汉光谷觉得处理不公，申诉无效之后决定正式退出中超。

湖北绿茵足球俱乐部，成立于2009年2月的中国大陆足球俱乐部。其主体来源于已解散的武汉光谷足球队和参加第十一届全运会的湖北全运会代表队，该俱乐部参加了09年中国足球乙级联赛，并且在中乙总决赛中冲甲成功

2010年湖北东方国旅冠名湖北绿茵足球俱乐部，2011年1月10日湖北绿茵足球俱乐部更名湖北武汉中博职业足球俱乐部。2011年12月更名为武汉卓尔职业足球俱乐部。

中超球衣图鉴（16）：湖北足球26年兴衰 卓尔为汉军代言

2012年10月6日，武汉卓尔提前三轮冲超成功。

2013年10月提前三轮中超降级

2014年武汉卓尔在中甲联赛第3名

2015年武汉卓尔在中甲联赛第10名

一年后的2016年，卡尔美设计力爆棚元年，武汉卓尔就穿上了这件以荆楚青铜器纹样为主题的精美球衣。

17年，就在“独立设计风”吹遍中甲中乙，连中超球迷都羡慕嫉妒恨之时，武汉卓尔展现了自己卓尔不群，独树一帜的选择题尴尬症，居然吃了耐克这根回头草！于是耐克很自然地顺手拿了一件跟2014一样的空白训练衫。

2018年10月6日，中甲联赛第27轮主场2-2战平梅县铁汉，提前三轮冲超成功，锁定中甲冠军。

2019年11月27日，中超联赛第30轮主客场1-0战胜重庆斯威，提前锁定了本赛季中超第六名的位置。另外，44分也超越了此前2005年武汉队在中超最高分（42分）纪录。

2020赛季球衣